Arquitetura PAEBIRU — Bounded Contexts

Documentação detalhada por subsistema. Conforme a RFC 050, o ecossistema é organizado em contextos delimitados que espelham a estrutura física do repositório.

Organização dos Módulos (Bounded Contexts)

Bloco / Contexto	Diretório Físico	Responsabilidade Estrutural
ONTOLOGY	N/A	Axioma primordial: Deus sive Natura (Entropia e Lógica).
MATH	`crates/paebiru-math`	Isola a stack matemática, simulações termodinâmicas e correção Reed-Solomon.
KERNEL	`crates/paebiru-kernel`	Espinha Dorsal: Proof-of-Location, Consenso ZK, Transporte RINA e Ouroboros.
BIOLOGY	`crates/paebiru-biology`	Organismo: Autopoiese Rizomática, Agentes `Abaporu` e Roteamento Estigmergico.
ECONOMY	`crates/paebiru-economy`	Tecido: `BarterEngine`, Escambo de Joule e Crédito Mútuo Zero-Sum.
CAPIBA	`crates/paebiru-capiba`	Arquitetura de Blocos: Memória causal, imutável e persistência recursiva.
PLASMIDS	`crates/plasmids`	Máquina de Estado: Parsing e execução da DSL em TOML (Contratos).
HAL	`crates/hal`	Adapters (Hardware): Camada de abstração multiarquitetura `no_std`.
SDK	`crates/sdk`	Fronteira / Integração: Abstração de alto nível para desenvolvedores.
BINDINGS	`crates/bindings`	Interoperabilidade (FFI): Ponteiros opacos para as 13 linguagens suportadas.
CLI	`apps/cli`	Interface: Utilitário Forge para operação, status e flash.

Detalhamento de Subsistemas

Subsistema	Escopo Técnico
KERNEL.md	Transporte RINA Delta-T, QSTP, CRDT/DVV, ZeroTrustPipeline (5 gates), Data Mesh, GALS, PoL (TDOA/RSSI/AOA), Applied SR, `MacrophageVM`, `Compute-over-Data (CoD)`, `CryptographicVault`, `OuroborosEngine`, `hal::plasticity`
BIOLOGY.md	`AbaporuActor`, SMoT, Negociação de Intenção, Estigmergia, Coerência Quântica, TCM/Betti, Ripple Effect Protocol, IoA L8/L9, metabolismo algedônico, SNN/GhostSR, sobrevivência via esporulação, Plasticidade de Hardware
ECONOMY.md	`BarterEngine`, `JouleLottery`, `IsingMatcher`, crédito mútuo, liquidação x402, governança DRE-ponderada, Organic DAO, MycorrhizalSymbiosis
ENTROPY.md	`EntropySource` (TRNG/PUF), NIST SP 800-90B health, reversible logic (Toffoli/Fredkin), p-bits Ising, acoplamento térmico, Landauer Ledger
LEARNING.md	FedAvg, Split-DNN, agregadores bizantinos (Krum/TM/FoolsGold), quantização algedônica, Langevin SGD, fundação via RFC 010
CAPIBA.md	Arquitetura de blocos causais (Nascente → Oceano → Vácuo Quântico), Maturidade Causal, Reed-Solomon, Polytemporal Clocks e Ouroboros Cold Archive
API.md	`ApiServer` (porta 1975), middleware x402 (Payment Required), DRE Multiplier, Prometheus `regional_pain` gauge
BRIDGES.md	Padrão Bridge (`mock://` scheme), Chainlink Functions, Filecoin/IPFS, IoTeX W3bstream
THE_REALITY_IS_FRACTAL.md	Ensaio transversal — recursividade fractal do protocolo

Como esta seção se relaciona com o resto da documentação

Visão e escopo: ../theory/introduction.md define o panorama completo, o mapeamento doc↔código (theory/workspace_mapping.md), o corte v1/v2+/pesquisa (theory/workspace_mapping.md) e as questões em aberto (theory/workspace_mapping.md).
Plano de execução: ../ROADMAP.md organiza as entregas em 17 fases.
Especificações normativas: ../rfc/README.md — RFCs 000–014 (ratificadas) e 015–022 (Open Questions).
Referência transversal: glossário canônico em ../reference/DICTIONARY.md; padrões reutilizáveis em ../reference/PATTERNS.md; stack matemática em ../reference/MATHEMATICS.md.

Questões em Aberto por Bloco

RFCs Open Question que bloqueiam decisões em cada bloco. Consulte ../rfc/README.md para detalhes.

Bloco	RFCs bloqueadores
KERNEL	015 (TEE admission)
BIOLOGY	N/A (RFC 019 ratificada)
ECONOMY	N/A (RFC 017 ratificada)
ENTROPY	020 (SP 800-90B health-test)
LEARNING	N/A (RFC 019 ratificada)
CAPIBA	N/A (RFC 017 ratificada)
API	N/A (RFC 017 ratificada)
BRIDGES	N/A (RFC 016 ratificada)
— global —	021 (reconciliação workspace doc↔git), 022 (calibração)

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